十五年前，神明大人将世界整个舍弃。没有人出生，也没有人死亡。在绝望遍布的世界中能给予死者唯一慰藉的存在是“墓守”。爱是一位墓守。今天也整整挖了47个坟墓。晚上回到村子与温柔的村民们围在一起嬉戏。但是那一天有什么不对。银色的…

自己的阳台栏杆上出现了像被单一样挂在上面的少女，这种非现实的情节出现在了上条当麻的眼前。虽然在这个城市——最先进科学引导的学院都市中，超能力已经可以通过科学技术创造出来，但是眼前这位自称“茵蒂克丝”的少女还是把上条当麻吓…

年幼的爱力克兄弟十分思念去世的母亲，不惜触犯炼金术中最大的禁忌，进行了人体炼成。可是炼成失败了，哥哥爱德华失去了左腿与右臂，弟弟阿尔冯斯失去了身体，只能把灵魂附身在一副铠甲上。为了偿还他们自己的罪，找回失去的一切，兄弟二…