四处飘泊的主角风间刚因为听到哥哥将人失踪的消息而回到拳王流道馆，但馆主泷道行声称将人是因为害怕比试而失踪，对于泷的出言侮辱风间刚向其发出挑战，且轻松地击败了泷。其后，刚在拳王流学徒中得知将人是被抓走的。输掉的泷心生不忿，…

1999年，日本东京都警视厅为了打击罪犯，成立了特殊部队ZAC(Zero Section Armed Constable、零课装甲警察部队，通称为Cybercop)。ZAC身着BitSuit打击犯罪组织Destrap。

超古代的地球曾经拥有相当高度的文明，但宇宙联盟奥可夫·马纳夫担心人类文明会破坏宇宙的和平，所以出动大军将人类文明彻底消灭。时至现代，地球上已经筑起了新的文明，但宇宙联盟的威胁亦再次出现。为了人类的未来，凭借超古代文明而觉…